Glavna služba za reviziju javnog sektora u Republici Srpskoj dala je pozitivno mišljenje na finansijske izvještaje Fonda zdravstvenog osiguranja RS u prošloj godini, ne izražavajući ni jednu rezervu.
"Po našem mišljenju finansijski izvještaji istinito i objektivno, po svim bitnim pitanjima, prikazuju stanje imovine i obaveza na dan 31. decembar 2011. godine, rezultat poslovanja i izvršenje Finansijskog plana  Fonda za godinu koja se završava na taj dan, u skladu s Međunarodnim računovodstvenim standardima i Međunarodnim standardima finansijskog izvještavanja. Finansijsko poslovanje Fonda u toku 2011. godine bilo je u svim materijalno značajnim aspektima usklađeno s važećim zakonskim propisima", navedeno je u revizorskom izvještaju, koji je danas dostavljen Fondu.
Glavna služba za reviziju u svom izvještaju je ukazala na neke okolnosti na  koje Fond ne može da utiče, ali imaju nepovoljan uticaj  na poslovanje. 
U prvom redu Revizija ukazuje na nepovoljan uticaj obavezujućih propisa višeg nivoa vlasti, kao što su Budžet RS, kojim su planirana manja sredstva za zdravstveno osiguranje nezaposlenih lica nego što bi trebalo prema Zakonu o doprinosima; Uredba o dopuni Uredbe o indirektnom zaduživanju RS za račun fondova i javnih zdravstvenih ustanova, prema kojoj rizik nemogućnosti zdravstvenih ustanova da izmire obaveze pada na teret Fonda, bez instrumenata koji bi štitili interese Fonda; Odluka Vlade o naplati doprinosa u akcijama, čija je fer vrijednost znatno manja od nominalne vrijednosti po  kojoj je izvršena naplata doprinosa.
Navedene okolnosti, kaže se u izvještaju Glavne službe revizije, nepovoljno utiču na poslovanje i otežavaju obavljanje djelatnosti Fonda zdravstvenog osiguranja.