Zakonom o obaveznom zdravstvenom osiguranju Republike Srpske precizirano je u kojim slučajevima se može odobriti refundacija troškova zdravstvene zaštite. Osigurano lice ima pravo na refundaciju troškova zdravstvene zaštite u Republici koju je platio vlastitim sredstvima ili koju je vlastitim sredstvima platio član porodice osiguranog lica, u slučaju kada zdravstvena ustanova naplati zdravstvenu uslugu koju finansira obavezno zdravstveno osiguranje ili kada naplati participaciju osiguranom licu koji je oslobođen plaćanja ove obaveze. Takođe, pravo na refundaciju moguće je i kada zdravstvena ustanova koja ima ugovor sa FZO RS ne raspolaže sanitetskim materijalom ili medicinskim sredstvom koje se ugrađuje u dijelove tijela, a koje bi trebalo da obezbijedi, pa ih osiguranik sam kupi ili kada medicinsko sredstvo koje se nalazi na listi medicinskih sredstava koje finansira FZO  nije bilo dostupno u zdravstvenoj ustanovi koja ima ugovor sa Fondom. Kada je riječ o lijekovima osiguranik ima mogućnost da podnese zahtjev za refundaciju kada zdravstvena ustanova koja ima ugovor sa FZO RS pismeno izjasni da nije raspolagala lijekom koji se nalazi na listama lijekova koje finansira Fond, kako u domovima zdravlja, tako i na bolničkoj listi lijekova ili listi citotoksičnih, bioloških i pratećih lijekova. Osim toga, postoji mogućnost refundacije i kada konzilijum bolnice sa kojom FZO ima ugovor da pismenu preporuku za primjenu lijeka koji se ne nalazi na listama lijekova koje finansira FZO RS (bolničkoj ili listi citotoksičnih, bioloških i pratećih lijekova) ili kada se lijek koji se nalazi na Listi lijekova koji se izdaju na recept nije dostupan u apotekama koje imaju ugovor sa FZO RS.

Kod refundacije je neophodno je da se uz zahtjev za refundaciju troškova, koji popunjavaju radnici FZO na licu mjesta, u nadležnoj poslovnici Fonda priloži i kopija medicinske dokumentacije iz koje se vidi da je neka usluga ili lijek preporučen. Takođe, potrebno je priložiti originalan račun (dokaz o plaćanju na ime osiguranika sa specifikacijom - nota račun, priznanica...), fiskalni račun, fotokopiju kartice tekućeg računa kod nadležne banke, te ponijeti zdravstvenu karticu na uvid.

Zahtjev za refundaciju se može podnijeti u roku od godinu dana od kada je osiguranik platio neku zdravstvenu uslugu ili lijek. Refundacija se odobrava osiguranom licu pod uslovom da je uplatilac doprinosa izmirio sve dospjele obaveze  za doprinose za obavezno zdravstveno osiguranje.